С 29 июня 2011 г. таможенным органам переданы полномочия на осуществление документарного санитарно-карантинного контроля в пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации.
 Должностные лица таможенных органов проверяют наличие документа, подтверждающего безопасность товаров в части соответствия санитарно-эпидемиологическим и гигиеническим требованиям, и сведения, содержащиеся в транспортных (перевозочных) и (или) коммерческих документах.
 В результате проверки принимается решение о возможности ввоза подконтрольных товаров или выявляются товары, подлежащие оценке (осмотру, досмотру) должностными лицами Роспотребнадзора.
 При осуществлении санитарно-карантинного контроля Роспотребнадзор и ФТС России обмениваются информацией и документами.
 В целях нормативно-правового регулирования обмена информацией и доступа к информационным ресурсам ФТС России и Роспотребнадзором издан совместный приказ от 15 августа 2011 г. № 706/1664 «Об утверждении Порядка информационного взаимодействия Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека и Федеральной таможенной службы при осуществлении санитарно-карантинного контроля в пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации».
 Приказом определен порядок информационного взаимодействия должностных лиц таможенных органов и Роспотребнадзора при осуществлении санитарно-карантинного контроля в пунктах пропуска, регламентирующий координацию совместных действий Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека и Федеральной таможенной службы в области санитарной охраны территории Российской Федерации и Таможенного союза от завоза опасных грузов (товаров).
 Указанный порядок также определяет способы и формы информационного взаимодействия между Роспотребнадзором и ФТС России при осуществлении санитарно-карантинного контроля в пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации