Сокращение времени нахождения поезда в пути при  следовании по маршруту Калининград – Москва возможно за счет увеличения скорости движения поезда и сокращения времени стоянок.  Выполнение данных мер позволит сократить время движения поезда примерно на 4 часа. К такому выводу пришли участники Рабочей группы Правительства Калининградской области по вопросам таможенного регулирования на территории области и Консультативного совета по таможенной политике при Калининградской областной таможне.

В настоящее время  скорый пассажирский поезд «Янтарь» проходит данный путь за 22 часа 05 минут. Смена локомотива от Калининграда до Москвы и обратно осуществляется 4 раза: в Нестерове, Вильнюсе, Минске и Вязьме. В результате средняя скорость скорого поезда составляет 58 км/час.

Участники Рабочей группы предложили рассмотреть следующие варианты:
- внешний осмотр пассажирского состава ПУ ФСБ России по Калининградской области осуществлять на станции Калининград.
- проведение сотрудниками ГКО контрольных операций во время движения поезда от станции Черняховск до станции Нестеров.
- смену локомотива осуществлять однократно на станции Минск.

Участники  Рабочей группы подтвердили, что нерешёнными еще остаются вопросы организации контроля ГКО Литвы во время движения пассажирского поезда Калининград-Москва по территории  государства - члена ЕС и территории Республики Беларусь, однако подобные вопросы уже ведутся МИД заинтересованных стран.